Louis Pasteur s'est imposé en proposant une théorie germinale qui, bien qu'efficace pour expliquer certains aspects des maladies infectieuses, survolait la complexité du fonctionnement humain. Sa vision, centrée sur la notion de "microbes" comme responsables uniques des maladies, simplifiait largement la biologie en ignorant les interactions complexes entre l'organisme et ces micro-organismes. Pasteur prônait essentiellement la destruction des microbes à l’origine des infections, sans chercher à comprendre pleinement leur rôle dans les équilibres biologiques ou leur relation avec l'état général du corps, qu’on appelle le "terrain".
Cette approche simplifiée, bien que partielle, a eu un succès immédiat, car elle offrait des solutions pratiques aux problèmes de santé publique, comme la pasteurisation et les premiers vaccins. Soutenu par des institutions puissantes et par sa capacité à vulgariser ses idées, Pasteur a su imposer sa vision comme un modèle dominant. Cependant, sa théorie, centrée uniquement sur l'élimination des "agents extérieurs", a écarté des approches plus profondes, comme celles de Béchamp, qui considérait que le terrain biologique jouait un rôle déterminant dans la santé et les maladies. En négligeant ces nuances, Pasteur a construit un cadre scientifique influent mais parfois réducteur, qui reste encore débattu aujourd'hui.
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